С момента основания храма, по настоящий момент настоятелем храма является - протоиерей Николай Хлынин. Закончил Ставропольскую Духовную Семинарию и Московскую Духовную Академию. В сан диакона рукоположен 21 ноября 1996 года, в сане диакона служил в Соборе Михаила Архангела до мая 2000 года. 9 мая 2000 года был рукоположен в сан иерея и назначен настоятелем на новообразованный приход в микрорайоне Мамайка.
В настоящее время вторым священником в храме великомученика Пантелеимона служит выпускник Краснодарской Духовной Семинарии, иерей Даниил Волосников.